जिल्ला आयुर्वेद स्वास्थ्य केन्द्र म्याग्दि वि.सं २०५४ सालमा स्थापना भएको थियो । विगतमा यो कार्यालय स्वास्थ्य मन्त्रालय, आयुर्वेद विभाग अन्तर्गत सञ्चालनमा थियो भने हाल संघियता पश्चात यो कार्यालय गण्डकी प्रदेश सरकार, सामाजिक विकास तथा स्वास्थ्य मन्त्रालय, स्वास्थ्य निर्देशनालय अन्तर्गत सञ्चालनमा छ ।  यस कार्यालय म्याग्दि जिल्लाको बेनी नगरपालिका वडा नं ८ मा अवस्थित छ । विगतमा यस कार्यालय अन्तर्गत २ वटा औषधालय सञ्चालनमा रहेकामा हाल संघियता कार्यान्वयन पछि ती औषधालयहरु स्थानिय तह अन्तर्गत सञ्चालनमा रहेका छन् । हाल यस म्याग्दि जिल्लामा नागरिक आरोग्य केन्द्र, औषधालय एवं यस जिल्ला आयुर्वेद गरि सबै ६ वटा पालिकामा आयुर्वेद सेवा सञ्चालनमा छ ।